Nam Leyte chiếm 1/4 diện tích của đảo Leyte. Tỉnh giáp với tỉnh Leyte ở phía bắc, Eo biển Surigao ở phía đông, biển Bohol ở phía Nam. Địa hình tỉnh có các vùng đất tương đối bằng phẳng ở dọc theo bờ biển nhưng địa hình gồ ghề và đồi núi khi đi sâu vào trong lục địa.

Theo số liệu quốc gia, tỉnh có 93 con sông, trong đó con sông Subangdaku là lớn nhất và đã gây ra một số trận lũ lụt gây nhiều thiệt hại. Núi Nacolod là điểm cao nhất tỉnh với 948 m trên mực nước biển